GEO-Samos bietet eine umfassende Protokollierung aller Arbeitsschritte. Jede Berechnung wird innerhalb des Protokolls zu einem Block zusammengefasst. Diese Blöcke können ein- und ausgeschaltet werden. Das Einfügen von Seitenumbrüchen ist möglich. Das Protokoll kann nach RTF exportiert und z.B. mit MS Word weiter bearbeitet werden.